Cinq peuplements considérés : algues, coraux, mollusques, échinodermes et poissons.

Les algues
Seules les macroalgues présentes tout au long de l’année ont été quantifiées. Les algues à présence saisonnière (Boodlea, Hydroclathrus et Chnoospora) ne sont pas étudiées ici puisque l’étude porte sur la variabilité des peuplements à long terme. Les macroalgues sont étudiées au rang générique compte tenu de la difficulté d’identification au niveau de l’espèce. Elles sont étudiées sur les points 2 et 3 de la carte ci-dessous.

Les coraux
Les coraux échantillonnés appartiennent aux Madréporaires (classe des Anthozoaires) et aux Hydrocoralliaires (classe des Hydrozoaires). Les coraux ont été déterminés jusqu’au genre étant donné la systématique complexe des coraux. Ils sont étudiés sur les points 1, 2, 3 et 6 de la carte ci-dessous.

Les mollusques
Les mollusques testacés épigés (vivant à la surface du substrat ou à son voisinage) et endogés (vivant enfouis dans le substrat) d’une taille supérieure à 5 mm ont été échantillonnés. Les mollusques parasites (famille des Eulimidae) n’ont pas été considérés. Ils appartiennent aux classes des Gastéropodes (Prosobranches et Opisthobranches) et des Bivalves. Ils sont étudiés sur les points 2 et 3 de la carte ci-dessous.

Les échinodermes
Pour les échinodermes, seules les espèces épigées appartenant aux Echinidés et aux Holothurides ont été étudiés. Ils sont étudiés sur les points 2 et 3 de la carte ci-dessous.

Les poissons
Les poissons ont été comptés sans distinction de taille et donc d’âge, contrairement au programme ATPP. L’estimation de taille n’est réalisée que depuis 2008. L’ensemble de la communauté ichtyologique, dans toute la colonne d’eau depuis le fond jusqu’à la surface, est prise en compte, soient toutes les espèces visibles. Tous les poissons observés sont identifiés jusqu’au niveau de l’espèce et sont comptés. Ils sont étudiés sur les points 2, 3, 5 et pour certaines espèces en 6 de la carte ci-dessous.